黑旗军，最早见于中国的近现代史上，是19世纪60年代由刘永福在广西的六安建立，因为以七星黑旗为战旗，故叫黑旗军。
刘永福当时所处的社会，正是中国发生三千年未有之变局的时代，清朝腐败政府在国外侵略势力的武力打压下，接连签订了《南京条约》等一系列丧权辱国的条约。战后割地赔款使中国的社会经济发生了重大的变化，在侵略者和清政府的压榨下，社会矛盾空前激化，爆发了一次次的农民起义，尤其是洪秀全领导的太平天国革命将无数分散的农民起义汇聚成中国近代史上第一次反帝反封建的革命高潮。
在这样的时代背景下，又加之天灾人祸的打击（刘永福16岁那年，父母及叔父因贫病交加先后不幸去世），刘永福的心中埋下了反抗的火种。也正在此时，反抗清朝封建统治的农民起义风起云涌，刘永福开始寻找自己可以投奔的起义队伍。1857年，也就是刘永福20岁的时候，他毅然地离开几乎已不存在的家，束发投奔天地会旗头郑三领导的起义队伍。
以后，刘永福又先后投奔吴二、王士林、黄思宏、吴亚忠等农民起义队伍。在吴亚忠领导的起义军中，刘永福的军事才能得到了较大的提高和发挥。也正是在这个时候，刘永福创建了“黑旗军”，他们以七星黑旗为军旗，并举行了祭旗仪式。黑旗军初创时有200多人，基本成员是贫困的农民。在刘永福的带领下，黑旗军屡战屡胜，使敌人闻风丧胆、坐卧不宁。虽然刘永福领导的黑旗军屡建奇功，经受了一次又一次严峻的考验，在政治上和军事上日趋成熟，但这时太平天国运动已经失败，全国的农民革命正从高潮走向低潮。清政府为了乘势将仍在全国各地不屈不挠坚持反清斗争的农民起义镇压下去，以消除心腹之患，下令对农民起义尽绝根诛，“不令余烬复炽”。
与此同时，派出数倍于起义军的清兵，采取堡垒合围战术，步步为首，四面进攻，围追堵截，务求斩尽杀绝。在这种敌我力量十分悬殊的形势下，为了保存有生力量，刘永福率领黑旗军向中越边境实行战略转移，最后抵达六安。在六安，刘永福正式创建立了黑旗军，以七星黑旗为军旗，并制定了严密的军事编制和严明的纪律。黑旗军铲除了横行霸道于中越边境一带的封建割据势力和土匪势力，稳定社会治安，维护百姓利益，鼓励开垦荒地，发展农业生产，鼓励民间正常贸易，并实行税收制度以解决军饷。刘永福在中越边境所做的一切获得了越南人民和政府的信任，这为他以后赴越抗法，赴台抗日打下了一定的基础。
1894年，日本挑起了对中国的侵略战争，甲午战争爆发，日本侵略台湾。由于清政府在战争一开始就推行投降主义路线，中国军队在海陆战场上连连败北；而日本侵略者在海陆战场上的轻易取胜，更进一步助长了其鲸吞整个中国的野心。日本侵略者的狼子野心让刘永福毅然率领黑旗军抵达台湾抵抗日本侵略者，并驻守于台南地区。1895年，刘永福以黑旗军为主力，团结台湾友军，在台湾转战台南，台中，台北与日军浴血奋战5个月，终于重创日军。
萧天在大学的时候每每看到这一段刘永福在台湾抵抗日本侵略者的时候，心中都难以抑制地流动着一种豪情，大大地感叹现实的社会没有给予他这个机会。萧天也曾经无数次把自己假想为抗击外国侵略者的刘永福，率领黑旗军把外国侵略者从中国的领土上赶出去，也能象刘永福一样成为万人仰慕的民族英雄。
虽时光流转，但情怀依旧。当时间的指针指向20世纪末的1999年，地点也是台湾省的台南市，萧天也在今天正式宣布了他的黑帮名字就叫黑旗军，已经仙去近一个世纪的刘永福怎么也不会想到阴差阳之下，他曾经引以为傲的黑旗军在萧天的手中，在20世纪的最后一年又重新建立在台湾的土地上，领军人物正是年近20岁的萧天。
所谓无尽黑道，群雄崛起！
黑旗无敌，纵横天下！
统帅黑旗，唯有萧天！
今天夜里，一共整合潮洲帮人马396人，萧天把所有人马兵分两路，李东，张刚率领三大金刚带领一路，从台南东面开始对各个帮派的场子进行扫荡，萧天率领水哥，火凤，飘雪，六叔等人带领另一路，从台南西面开始对其他帮派进行围剿，务必在最短的时间吞并除三联社之外的所有帮会。
萧天给所有兄弟下了死命令，能和平吞并就和平吞并，不能和平吞并一定要斩草除根，不给任何帮派死灰复燃的机会。
众兄弟轰然领命后，各自带领所辖人马象两条黑色的暗流象台南市中心涌去。
广场上还一丝丝淡淡的血腥味还在飘荡，但是已经看不到一具尸体，所有尸体已经由萧天命人全部清理干净，整个广场的霓红依然闪烁，月光依旧照人。
连续三天，不分昼夜的和平谈判和无情厮杀。
经历了三天的杀戮，水哥和加入黑旗军的潮洲帮的兄弟才真正见识到了萧天的辣手无情还有那决心一统台湾黑道的野心，所有都庆幸在那一晚没有丝毫犹豫地加入了萧天的黑旗军。萧天的谈判丝毫不拖泥带水，甚至前一秒钟还在和你和颜悦色。如果不归顺，后一秒钟就可以把刀捅进你的胸膛，更让水哥下面的潮洲帮的人感叹的是所有帮派不管大小，竟然都没有反抗萧天的力量。
应该说两路人马分兵后，只是一百多人不到两百人的，在台南市一般的小帮派都能有这样的实力。水哥看出萧天明白自己的处境和实力，所以他第一个狙杀的对象往往都是对方的老大，更可怜的是所有老大甚至都不知道自己是怎么死的。水哥看出说到底，凡是死在萧天手上的各帮派大哥都根本没有把萧天这个毛头小子放在眼里，加之萧天下手也是够狠，手下兄弟实力强悍。当然有的帮派大哥顺利收服还是依靠水哥的指引。而这些进入黑旗军的本来还不太服气的大哥在看到萧天扫荡下一个帮派的手段后，都会无一例外地感谢水哥救了他们一命。
水哥心头苦笑道，照这样的雷霆扫荡，台湾黑道总有一天都会在萧天的掌控之下。不过好歹自己也算是开国的元老，将来自己的好处也一定会多多的。
三天的时间，没有任何悬念，萧天和李东的两路人马成功地扫除了除了三联社意以外的大大小小的二十多个帮派，共接收台南市区夜总会72个，歌厅、舞厅、酒楼达到上百家，以及各个帮派的黑道生意，萧天手下人马达到了近3000人。