和王伦统一了意见后，朱武次日就召集众头领，在鲁智深主动谦让下，让吴用坐上第三把交椅。
然后，在朱武的提议下，阮小二、阮小五、阮小七三人排在栾廷玉之后、扈成之前，同样坐上交椅。
为吴用授予八级军衔、为三阮授予七级军衔，勉励他们为梁山泊立功后，朱武让王伦出面，提出军政分离。
这个提议一出，梁山泊在坐的十几位头领，都是议论纷纷。刚坐上第三把交椅的吴用，率先向众人道：
“军政事务分离，是梁山泊壮大之后，必须要实行的。”
“否则分寨越多，就越是难以控制。”
“分寨的军政事务分离后，由头领分别掌管，梁山泊对分寨的掌控，一定会更强力！”
从梁山泊对分寨的掌控来看，吴用认为在军政分离后，梁山泊对分寨的掌控，会更上一个台阶。对于打算以扩充分寨的形式提高实力的梁山泊来说，可谓极为有利。
甚至，吴用还明白军政分离后，自己作为梁山泊的三头领，一定会负责军政其中之一。这对他在梁山泊立足，同样大有裨益。
故而这件事虽然是王伦提出来，吴用却第一个赞同，让其他议论纷纷的头领，尽皆安静下来。
前三位头领同意，鲁智深、林冲、李应等人也附和，梁山泊其他头领，自然无法反对。
故而，军政分离的事情，被朱武推行下去。
雷厉风行，毫不停歇，朱武首先便成立军务院和政务院，命人在聚义厅旁边，建造两个院子。在院子没有建好前，政务院在聚义厅东边房里办公，军务院在西边房里办公。原本的办公厅事务，大多被移交给政务院和军务院。办公厅主要工作，转向为朱武服务。办公厅主任位置，暂时仍旧由王伦兼任。
然后，朱武又任命王伦为参赞军政头领，扈成为参赞政务头领，一起负责政务院。原办公厅庶务处、财务处、外联处三个部门，大多归政务院管理。
唯有李应仍想在军中任职，带着一部分财务处人员，去军务院组建了后勤处。朱武见财务处副处长朱贵暂时撑不起来，又考虑到王伦想负责钱粮事务，就让他兼领了财务处。外联处仍旧由扈成负责，结交四方豪杰。
相比政务院只有两个参赞头领，军务院这边就多了。除了吴用这个参赞军政头领外，鲁智深、林冲、李应三人，被朱武任命为参赞军务头领，和吴用一起主持军务院。
在朱武的规划下，军务院设立庶务处、参谋处、教导处、后勤处、装备处、训练处六个部门。除了教导处由朱武亲自执掌外，吴用主管庶务处和参谋处，李应主管后勤处，鲁智深主管装备处，林冲主管训练处。四个主要头领，各自负责一摊。
军务院名义上由吴用领导，但吴用在看到教导处由朱武亲自负责后，明智地收起了其它想法，只是把自己当做庶务处和参谋处长，等待戴宗前来，帮助自己立足。
不过即使如此，王伦在看到军务院部门众多、头领人才济济后，先前答应军政分离的他，也不觉有些后悔。只能以自己是参赞军政头领、能插手军务院为由，暗自安慰自己。
一番划分之后，朱武将梁山泊的权力，再次做出调整。然后他就在聚义厅，召开了政务院和军务院联席会议。
看着王伦、吴用、鲁智深、林冲、李应、扈成等属下，朱武第一次感觉到，自己的梁山泊不再是草台班子，而是向政权方向，再次迈出了一大步。
找到了一些开会的感觉，朱武轻咳一声，向王伦道：
“一年之计在于春，今年刚刚开始，咱们就做个规划，看看梁山泊在今年，能完成什么目标。”
“王先生负责政务院，你先说说政务院在今年，有什么目标没有。”
虽然没有准备，不习惯朱武这种方式。王伦在听到朱武询问后，还是将自己正在做的事情，向众人道了出来：