我不想用画笔捕捉世界，我想改变它！
——列昂纳多·达·芬奇（文艺复兴时期典型的艺术家）
上述的事实也就是说马其顿密集方阵的缺点也是显而易见的，这样密集的方阵不得不依靠骑兵和其他兵种保护其两翼，但骑兵是攻强于守，一旦被击溃，密集方阵的侧翼或者背后就容易受敌人攻击，那么这种死板的阵型就可能溃散而一发不可收拾。
而且方阵缺乏协同性，很难用于包围行动，只能与骑兵配合；亚历山大本人并不是死用这种方阵，他的骑兵从某种意义上说才是真正的主力，而且也足够的强大。
沟渠、树林、山脊、河流等等障碍，也常使得密集方阵被分割或者阻挡队型前进，一旦由此等原因造成阵型被破坏，那么产生的空隙很容易被敌人的近战部队利用，而结果大家也该都知道了。
虽然亚历山大大帝很好的解决了方阵的机动性问题，但不代表方阵就没有了问题；事实上，作为预备队，追击部队，以及保护者的骑兵反而容易被击败而导致整个战斗失败，因为亚历山大本人就在骑兵阵里（方阵需要保持阵型）。
这个问题在亚历山大对波斯军队的几场战斗中都有出现过，但波斯国王并没有抓住这些机会，谨慎的他认为亚历山大已经突破了他的前军和中军，而实际上是亚历山大误入了波斯的后阵。
出于宿命般的，亚历山大并没有战死，但在几千年后的三十年战争时，瑞典国王古斯塔夫二世就使用了类似的战术（列队火枪手、火炮方阵，胸甲骑兵保护侧翼），并因为误入敌阵阵亡……
马其顿方阵适应了马期顿作为一个新兴的奴隶制国家的结构，大量的农民和极少量的贵族，因此，主要由贵族公民组成的重甲兵不是马其顿的所长，另外重甲方阵在战埸和山地丘陵地区机动能力的低下，也不能满足马其顿征服需要。
新组建的马其顿方阵核心是由约一百人组成的长矛阵，在阵中完全取消了重甲兵，第一线士兵的盾也大为缩小，缩小的盾使士兵可以站得更紧密；同时，后方的矛渐次加长，最终所有的长矛手都可以对方阵前的敌人进行攻击，最长的达到十米之长！
如果以为马其顿方阵只是长矛，那就大错特错了，实际上在军队中列入方阵中的长矛手只有三分之一到四分之一，其余全部是弓箭手、战士、投石手、投枪手，这些士兵通常是非公民的平民、盟国的士兵、待释放的奴隶。
在作战中，他们以箭、石、投枪攻击敌人，减少方阵冲锋的压力，当敌人被方阵冲散压倒后，他们就跟上去杀伤散乱的敌人。
这种战法与中国古代的车战十分相似，先以战车冲散敌人，再与徒卒杀伤敌人；实际上春秋时晋国魏舒的毁车成行一役的作战方式与马其顿方阵就很相似，不同的是魏舒以弃车的甲兵剑盾阵代替了长矛阵而已，但他们同样取得了辉煌的胜利。
依靠马其顿方阵的战斗能力，腓力统一了希腊，亚历山大灭亡了波斯建立了亚历山大帝国；但是马其顿方阵的弱点就象他的优点一样特出，最大的弱点就是它的战斗力集中在前方，侧面只能依靠互相的保护，一旦对方突破侧翼，矛阵中的长矛兵别说抵抗，连逃生的机会也没有。